現代社會性的問題越來越複雜，教會裡的家庭問題亦越來越多，不能不正面面對。她呼籲教會在年青人範疇上作有關性教育及戀愛感情等教育工作，不要逃避。「這年代只講感情，若不能一次性地講好性及家庭，只是很表面的。」她表示現在青年人早熟，容易有性經驗，「教會年青人不講不等於無做。他們看來很乖，但當出事時往往更慘。」她又認為在這年代，青少年很早便在網絡世界裡對性進行探索。教會的青少年導師特別需要在性教育及家庭教育接受較深層次的訓練，這才可應付越趨複雜的青少年工作。
但她亦觀察到有牧者擔心在教會講「性」無關信仰，傷風敗俗，但她向大家派「定心丸」說：「《聖經》很好，對這些問題有很清楚的指導和方向，完全可以融入在性教育裡。導師只是需要學習如何活潑的把它們應用出來。」一次她在香港浸信會神學院教授婦女神學，在課程結束後，一位女教牧表示在參加課程之初頗有擔心，但後來感到獲益頗多。
程翠雲鼓勵教會信徒領袖參加性教育有關的培訓。她呼籲教會從事牧養工作的人參加：「教會的牧者真的要接受這樣的訓練。從過往參加了課程的牧者可以見到他們的認知與現實教會的年青人相差太遠，可以想像不參加的落差會更大。」她將於3月份在《時代論壇》開辦「一本性經──教會性教育實務工作坊」課程，分享有關性侵犯、青少年性問題、夫妻性協調及家庭性教育等四大題目，以幫助教牧及信徒領袖掌握專業的知識和實際技巧，幫助受性問題困擾的信徒。
對於教會的性教育，程翠雲感到樂觀。不少教會已積極進行性教育，當中不乏整個宗派參與，如平安福音堂、循道衞理會等。神召神學院、伯特利輔導中心等亦有提供相關課程。
程翠雲是青少年愛滋教育中心（Teen AIDS）創辦人、觸動輔導中心性治療及家庭治療總監；她亦是大學性教育及家庭教育課程講師、電台電視台節目主持以及報刊網絡專欄作家。
