按照解答圣经和属灵问题的“Got Questions”事工网(GotQuestions.org)的解释，也许两者最大的分别是对圣经的充足性和权威性的看法。按照传统来说，新教徒相信单单圣经的教导就足以使人从罪中得到拯救，圣经同时包含衡量基督徒行为的准则。然而，天主教徒认为只有圣经是不够的，他们把圣经和神圣的罗马天主教传统赋予同等的地位。
在天主教教义方面，例如炼狱、向圣人祷告、敬重玛利亚等，这些只有少部分或者几乎没有圣经根据的，但却是基于天主教的传统。
另外一个主要不同的地方就是教皇的权威和地位。在新教没有与教皇同等的一个位置，新教徒认为人人皆有罪，唯独基督是教会的元首。他们相信教会的属灵权柄建基于神的话语，而不是使徒统绪（apostolic succession），且相信所有信徒都能通过圣灵的引导明白神的话。
对于天主教徒来说，教皇就是“Vicar of Christ”，代表耶稣的位置，是教会可见的元首。因此，教皇的教导被所有的信徒视为绝对可靠和有效的。
另一方面，由于天主教强调教会的权威高于个别的信徒，因此教徒认为只有罗马天主教教会才可解经。而新教则相信在圣灵的引导下，所有信徒都有解经的权柄。
关于拯救论也是两者争论的焦点，传统上新教认为人唯有相信耶稣基督就能称义和得救。然而罗马天主教认为相信基督以外再要加上人的善行才能得救。天主教徒得救的过程中就包括了七项圣事：出生圣洗、坚振、圣体、圣秩、病人傅油、婚姻和告解。
根据浸信会报刊(Baptist Press)的报导，美南浸信会北美宣教部多种信仰协调员Tal Davis指出，天主教徒要通过天主教教会和圣事，来得到天主的恩宠。
他说："我们认为那些圣事是没有必要的，它们反而成为人走到神面前的障碍。我们是单单靠著信心走到耶稣基督面前得著救恩，没有人的作为。人不能拯救自己，也不能在神的拯救计划中增加任何东西。"
对天主徒来说，相信基督只是得救的开始，个人必须行善才能得到永远的救赎。例如一个人死后，如生前没有做足好的行为抵偿罪债，就要去炼狱。
新教徒也认同行善的重要性，但他们认为行善是得救后结出的果实，而非得救的一部分。
"简单来说，罗马天主教的救赎观是，基督在十字架上的赎罪不足以偿清信徒所犯的罪，因此信徒必须通过告解或在炼狱的时间，去赎出自己的罪。" “Got Questions” 事工网上资料说。
新教和天主教各有不同的地方，但也有几个核心信仰是一致的，包括圣三位一体、耶稣的神性、耶稣是无罪的事实，以及耶稣为人类的罪死在十字架上并从死里复活升到天上。
"当你和天主教徒谈话的时候，你不用说服他们相信神、耶稣基督或圣经。"Davis解释说。
受人敬重的神学家R. Albert Mohler博士近日再重申，尽管如此，新教和罗马天主教的分水岭是清楚的。他在Washington Post和Newsweek的专栏上写到，"我确信他(教宗)是不正确，在教廷的权力、圣事、神职人员、福音、对教会的理解上。"
"罗马天主教会认为新教徒处在属灵危险当中，因为他们倔强而不肯顺服天主教的普世性和罗马教廷。福音派教徒就担心天主教徒降服于这些说法而处在属灵的危险中。"他补充说。
根据中央情报局出版的《世界各国概况》，基督教占全世界人口的三分之一，其中天主教占17％，新教占5.8％，东正教占3.5％，英国圣公会占1.3％。与之相比，穆斯林占21％，印度教占13.3％，佛教占5.8％。
