中文大學的文化和宗教系在05年和06年先後成立了「人間佛教研究中心」、「天主教研究中心」和「道教文化研究中心」，為配合此發展，崇基神學院決定成立「基督教研究中心」。
因現在廣泛使用的「基督教」一詞多被理解為16世紀宗教改革運動後派生的新教傳統，忽略了天主教和正教也屬於「基督教」傳統不可或缺的一員。基督教研究中心確定主旨是推動和深化基督教三大傳統——基督教新教、天主教和正教的研究，並在香港和中國的多元文化及宗教處境下，促進基督教與其他信仰傳統及宗教的交流與對話，從而對現今社會做出貢獻。
揭幕嘉賓包括基督教三大傳統的領袖，包括天主教香港教區陳日君樞機、香港聖公會教省主教長鄺廣傑大主教、代表正教會香港及東亞教區都主教的Fr. Sean Govostes、基督教香港信義會監督戴浩輝監督、中華基督教會香港區會總幹事蘇成溢牧師、基督教香港崇真會會長丘頌元會長、香港循道衛理聯合教會前會長梁林開牧師，還有香港中文大學校長劉遵義教授、崇基學院院長梁元生教授和突破機構榮譽總幹事蔡元雲醫生。揭幕儀式在富有中國特色的音樂下進行，緊接著是富有中國特色的鳴鑼誌慶典禮。
崇基神學院院長暨研究中心主任盧龍光教授致詞中表示，這次香港基督教屆的出席陣容是空前的，正是向公衆證明了一點：有人以為基督教是四分五裂的，有人以為基督新教就等於基督教，其實在歷史上，還有天主教、正教；在香港及在全世界，不同基督教傳統統稱為基督教。盧牧師並表示，只要當各基督教傳統很好地交往和交流，才能對社會做出貢獻。
陳日君樞機為基督教研究中心的成立感到非常高興，他亦表示，不同基督教傳統有機會交流，增進互相了解，能對社會做出更大貢獻。
蘇成溢牧師會後表示，基督教不同宗派不同傳統但都在同一根源，如何在多元中合一，信徒需要更多更全面地，從歷史和普世的角度去認識教會，而非只局限於自己所屬的教會或者教派中。他盼望研究中心能夠把研究多與香港教牧和信徒分享。
專題研討會在茶會之後舉行，主題是「基督宗教在香港」。由鄺廣傑大主教、陳日君樞機和正教Fr. Sean Govostes分別講述基督教、天主教和正教在香港的歷史、現在與未來；蔡元雲醫生講述基督教在21世紀的香港，從文化角度講出基督教需要回應的問題和承擔的使命 。最後由中國社會科學院世界宗教研究所所長卓新平教授、蘇成溢牧師、以及崇基神學院助理教授邢福增教授回應。
基督教研究中心是不屬神學院，是一個宗教研究中心。但在衆多基督教領袖的講話中，均講及基督教不是在學術研究的内在的層面，而是一個拯救靈魂的工作，引發大家思想和反省基督教在今天和明天的使命，還有香港教會的扮演角色和未來要走的路向。
