在人類靈魂以動物精靈形式相伴的另一個平行世界裏，有一個小孩正站在自由的終點與新紀元的起點之間，她就是12歲的少女萊拉(Lyra)。她意外發現最要好的朋友羅格(Roger)被綁架後，在一個人類靈魂以動物精靈形式相伴的平行世界中展開了冒險旅程。根據原著，萊拉及其同伴所要對抗的邪惡當權組織為一名為「Globbers」的團體，該團體以誘拐小孩作為「灰塵實驗」(Dust Experiments)之用而惡名昭著。在黃金羅盤的指引下，萊拉找到失蹤孩童，並殺了一名作「神」(God)的反派角色。
儘管《魔幻羅盤》看似溫和而無傷大雅，但事實並非如此。在這三部曲中，小孤女在與老邁的神的壓迫中掙扎，最終獲得勝利；另一個角色是一位離開修院的修女，她描述基督教是「一個非常有力量和說服力的錯誤信仰」；而在最後一部書，其中有角色代表亞當與夏娃，他們最終把上帝殺死，而這位神的名字是耶和華。每一部書都在反映作者Phillip Pullman對神、對基督的敵意。
一些基督教人士和天主教媒體譴責《黑暗元素三部曲》系列，認為褻瀆了神和聖經。有些信仰人士勸戒廣大觀眾慎重考慮，勿要觀看及購買該產品。
據報導，Phillip Pullman是一位激進的無神論主義者及人文主義者，他宣稱《黑暗元素三部曲》講述了一場人類對抗教會，推翻神的戰爭。他非常反對魯益斯(C. S. Lewis)及其著作《納尼亞傳奇﹕獅子女巫魔衣櫥》，寫這三部曲的原因是為了沖淡魯益斯在納尼亞傳奇系列中所描繪、所象徵的基督。
據BBC新聞網報導，儘管菲力浦. 普曼一再貶斥《納尼亞傳奇: 獅子女巫魔衣櫥》，說這部電影「反動」、「有種族歧視嫌疑」、「歧視女性」。然而，一些美國基督教福音派的團體大力支持《納尼亞傳奇》。
「我們相信，神會通過《納尼亞傳奇﹕獅子女巫魔衣櫥》講述耶穌基督的福音。」伊利諾州葛培理佈道中心負責人Lon Allison說。
[資料來源：The Christian Post、BBC新聞網]
