筹备会同工陈定吉长老、朱台深牧师首先代表大会致欢迎词，陈长老指出，如今政府和人民都面临极大挑战，让我们谦卑来到神面前祷告。接著全福会弟兄带领众人颂赞，在敬拜主的歌声中，揭示主才是万王之王，一切权柄都从他而出。此外，大会邀请花莲更生团契少年学员献诗，见证年轻生命在主里的奇妙改变。
本届早餐会由寇绍恩牧师与夏忠坚牧师分别以华、台语证道，经文选自箴言9:10"敬畏耶和华是智慧的开端；认识至圣者便是聪明"、马太福音6:33"你们要先求他的国和他的义，这些东西都要加给你们了"，两人再三强调遵行神旨意、与神连结是国家得以转化的关键，也是当前危机的出路。
马英九总统致词时提到参与此次祷告会，让他回忆20多年前去美国参加国祷会的情景，而以"转化"为题，也让他想起美国近日经历的重大改变─ 首位非裔总统欧巴马的当选，"当年金恩博士追求公义、平等的梦如今终于实现。"马英九表示，台湾从过去到现在同样有很多转变，虽然仍有需要改进的部份，他相信以台湾人民的智慧与勇气可以度过今日金融危机的现实。
随后周神助牧师带领由原住民语、客语、台语、华语牧者组成的牧师团，接续为马英九总统按手祷告，象征台湾不同族群的合一。周神助牧师在祷告中说："希望马总统不仅是媒体的宠儿，更能成为天父的宠儿，使您在祂里面得以有公义，愿神赐下所罗门王的智慧，让您治理国家；又赐下大卫王的能力，得以在困境中带领国家。"
因公务繁多之故，马英九于大会结束前提早离去，接著由潘刘玉霞牧师、曾国生弟兄、杜明翰会长、杨宁亚牧师分别带领众人为台湾的经济、媒体、科技、娱乐、家庭等不同层面转化祷告。祷告中杨宁亚牧师提醒，金融风暴可能十年一次，但家庭风暴却天天在发生，"求圣灵把主耶稣的爱放在台湾每个家庭里，特别兴起家中的男人，当男人被兴起，家庭才有希望，当家庭被改变，国家社会才能真正有转化。"
历时逾两小时的国祷会，最后在全福会弟兄带领众人齐唱《耶和华祝福满满》歌声中圆满结束，大会执行长洪善群长老接受采访时表示，这次国祷会最美的一点是看到不同族群、不同教派的弟兄姊妹来到这里单单寻求神，看见众人的合一让他最觉感恩。
