籌備會同工陳定吉長老、朱台深牧師首先代表大會致歡迎詞，陳長老指出，如今政府和人民都面臨極大挑戰，讓我們謙卑來到神面前禱告。接著全福會弟兄帶領眾人頌讚，在敬拜主的歌聲中，揭示主才是萬王之王，一切權柄都從他而出。此外，大會邀請花蓮更生團契少年學員獻詩，見證年輕生命在主裡的奇妙改變。
本屆早餐會由寇紹恩牧師與夏忠堅牧師分別以華、台語證道，經文選自箴言9:10「敬畏耶和華是智慧的開端；認識至聖者便是聰明」、馬太福音6:33「你們要先求他的國和他的義，這些東西都要加給你們了」，兩人再三強調遵行神旨意、與神連結是國家得以轉化的關鍵，也是當前危機的出路。
馬英九總統致詞時提到參與此次禱告會，讓他回憶20多年前去美國參加國禱會的情景，而以「轉化」為題，也讓他想起美國近日經歷的重大改變─ 首位非裔總統歐巴馬的當選，「當年金恩博士追求公義、平等的夢如今終於實現。」馬英九表示，台灣從過去到現在同樣有很多轉變，雖然仍有需要改進的部份，他相信以台灣人民的智慧與勇氣可以度過今日金融危機的現實。
隨後周神助牧師帶領由原住民語、客語、台語、華語牧者組成的牧師團，接續為馬英九總統按手禱告，象徵台灣不同族群的合一。周神助牧師在禱告中說：「希望馬總統不僅是媒體的寵兒，更能成為天父的寵兒，使您在祂裡面得以有公義，願神賜下所羅門王的智慧，讓您治理國家；又賜下大衛王的能力，得以在困境中帶領國家。」
因公務繁多之故，馬英九於大會結束前提早離去，接著由潘劉玉霞牧師、曾國生弟兄、杜明翰會長、楊寧亞牧師分別帶領眾人為台灣的經濟、媒體、科技、娛樂、家庭等不同層面轉化禱告。禱告中楊寧亞牧師提醒，金融風暴可能十年一次，但家庭風暴卻天天在發生，「求聖靈把主耶穌的愛放在台灣每個家庭裡，特別興起家中的男人，當男人被興起，家庭才有希望，當家庭被改變，國家社會才能真正有轉化。」
歷時逾兩小時的國禱會，最後在全福會弟兄帶領眾人齊唱《耶和華祝福滿滿》歌聲中圓滿結束，大會執行長洪善群長老接受採訪時表示，這次國禱會最美的一點是看到不同族群、不同教派的弟兄姊妹來到這裡單單尋求神，看見眾人的合一讓他最覺感恩。
